南开大学现代物流研究中心成立于1999年，是南开大学与国家发改委共建单位。2005年，南开大学现代物流研究中心与天津可口可乐公司共建物流研发中心（R＆D）。

　　1985年在交通经济研究所基础上开展物流课程教育。1996年在产业经济学专业下培养物流方向研究生。2000年开始在产业经济学和区域经济学专业下培养物流方向的博士研究生。2003年中心申办物流学专业，获教育部批准，使物流学成为与产业经济学并列的二级学科。开始招收物流学专业研究生。同年开始招收博士后（物流方向）。2005年，申办物流管理专业，获教育部批准，开始招收物流管理专业本科生。2006年申办物流工程硕士，获教育部批准，开始招收物流工程硕士。